AWS HealthOmics kaynakları

Bu adım adım açıklamalı geliştirici kılavuzunda AWS HealthOmics'i nasıl kullanacağınızı öğrenin.

AWS HealthOmics API'leri ve parametreleri için bu referans kılavuzunu okuyun.

Bu kılavuz, HealthOmics ile çalışırken kullanıcı deneyimini geliştirmek için Kiro IDE içinde AWS HealthOmics Kiro Power ve IDE Uzantısını yükleme ve kullanma yönergelerini sunar.

Bu kılavuz, AWS HealthOmics kullanarak genomik iş akışları oluşturma, dağıtma ve çalıştırma sürecini anlatır.

Kiro CLI'den iş akışları oluşturmasını, çalışma günlüklerini analiz etmesini ve performans optimizasyonu önerilerinde bulunmasını isteyebilirsiniz.

HealthOmics iş akışlarını ve depolamayı kullanmaya başlayın

AWS HealthOmics'i kullanarak genomik ve biyolojik veri kümelerinin nasıl depolanacağını, işleneceğini ve sorgulanacağını gösteren örnek kod içeren GitHub'da açık kaynak deposu

HealthOmics motor uyumluluk denetimi, performans optimizasyonu önerileri, arıza teşhisi ile otomatik çalıştırma analizi ve iş akışı içe/dışa aktarma özelliklerinin yanı sıra söz dizimi vurgulama, kod tamamlama ve sorun giderme rehberliği sağlar.

HealthOmics MCP sunucusunu rehberlikle paketleyerek Kiro IDE temsilcisine HealthOmics iş akışı oluşturma ve optimizasyonunda uzmanlık kazandırır.

Genomik iş akışı yönetimi, yürütmesi ve analizi için yapay zeka asistanlarına AWS HealthOmics hizmetlerine kapsamlı erişme imkanı sunan bir Model Bağlam Protokolü (MCP) sunucusu.

İlaç keşfini hızlandırmak için AWS HealthOmics iş akışlarının bu koleksiyonunu kullanın

Açık kaynaklı HealthOmics iş akışı örneklerine dayalı özel iş akışları oluşturun

Çalıştırma analiz aracı, CloudWatch'tan çalıştırma bildirimi günlüklerini alan ve her bir iş akışı görevi için CPU ve bellek kullanımı dahil olmak üzere çalıştırma için istatistikler üreten bir çalıştırma performansı optimizasyon aracıdır

İş akışlarını çalıştırmadan önce yaygın iş akışı hatalarını tespit etmek için HealthOmics WDL Linter'ı kullanın

Bir iş akışı komut dosyası çalıştırılmadan önce yaygın Nextflow hataları için Lint

CloudWatch çalıştırma bildirimi günlüklerinden arşivlenmiş çalıştırmaları yeniden çalıştırın

Bir AWS HealthOmics referansından veya okuma setinden dosyaları kolayca indirin

Amazon S3'te nesneler oluşturulduğunda AWS HealthOmics dizi depolarına veri içe aktarmayı otomatikleştiren olay odaklı bir mimariyi gösteren CDK uygulaması.

AWS HealthOmics dizi deposu içe aktarma işleri için bir json bildirimi oluşturur

AWS HealthOmics dizi depolarında depolanan yinelenen okuma kümelerini tanımlar

Bu Rehber, hem laboratuvar aleti verilerini hem de elektronik laboratuvar not defterleri (ELN'ler) ve laboratuvar bilgi yönetim sistemleri (LIMS) gibi yazılım sistemlerini HealthOmics ile entegre eden bilimsel bir veri yönetim sisteminin nasıl oluşturulacağını göstermektedir.

Bu Rehber, yaşam bilimleri veri araçlarını ve laboratuvar sistem dosyalarını internet üzerinden veya düşük gecikme süresiyle doğrudan bir bağlantı üzerinden AWS Bulut'a bağlamanıza yardımcı olur.

Bu Rehber, omik dizi verilerinin Amazon Basit Depolama Hizmeti'nden (Amazon S3) AWS HealthOmics Depolama Alanı'na nasıl aktarılacağını açıklar.

Bu Rehber, çok modlu sağlık hizmetleri ve yaşam bilimleri (HCLS) verilerini analiz etmek için uçtan uca bir çerçevenin nasıl kurulacağını gösterir.

Bu Rehber, üretim düzeyinde biyoinformatik iş akışlarını geniş ölçekte nasıl oluşturup çalıştırabileceğinizi ve AWS hizmetlerini; otomasyon, iş akışı analizi, depolama, ayrıca operasyonel ve maliyet gözlemlenebilirliği için nasıl kullanabileceğinizi gösterir.