AWS HealthOmics hiện hỗ trợ cấu hình Nextflow
AWS HealthOmics hiện hỗ trợ cấu hình Nextflow, cho phép khách hàng kích hoạt cài đặt thực thi được xác định trước tại thời điểm chạy. Cấu hình Nextflow cho phép khách hàng xác định các cài đặt có thể tái sử dụng và chọn các cài đặt đó tại điểm thực thi, giúp dễ dàng chuyển đổi giữa các cài đặt thực thi mà không cần sửa đổi mã nguồn quy trình công việc. AWS HealthOmics là dịch vụ đủ điều kiện theo Đạo luật về trách nhiệm giải trình và cung cấp thông tin bảo hiểm y tế (HIPAA), hỗ trợ khách hàng trong lĩnh vực chăm sóc sức khỏe và khoa học đời sống thúc đẩy các bước đột phá khoa học trên quy mô lớn thông qua quy trình làm việc tin sinh học được quản lý hoàn toàn.
Với cấu hình Nextflow, bạn có thể tách rõ ràng các cài đặt riêng cho từng nền tảng như giới hạn tài nguyên hoặc tùy chọn thực thi khỏi logic quy trình công việc cốt lõi. Bạn có thể chuyển đổi giữa cài đặt phát triển và sản xuất mà không cần tạo định nghĩa quy trình công việc riêng biệt. Điều này giúp giảm lỗi do chỉnh sửa thủ công, tăng tốc tính di động của quy trình công việc và tiết kiệm thời gian khi điều chỉnh quy mô từ phát triển đến sản xuất. Nếu sử dụng quy trình công việc nf-core, giờ đây bạn có thể kích hoạt các cấu hình tích hợp sẵn và cấu hình tổ chức vốn đã được cung cấp cùng các quy trình đó.
Giờ đây, bạn có thể chỉ định một hoặc nhiều cấu hình Nextflow trong các lượt chạy quy trình công việc của mình ở tất cả các Khu vực AWS HealthOmics: Miền Đông Hoa Kỳ (Bắc Virginia), Miền Tây Hoa Kỳ (Oregon), Châu Âu (Frankfurt, Ireland, London), Israel (Tel Aviv) và Châu Á Thái Bình Dương (Singapore, Seoul). Để tìm hiểu thêm, hãy truy cập phần Cấu hình Nextflow trên tài liệu về cài đặt công cụ Nextflow của HealthOmics.