AWS HealthOmics รองรับโปรไฟล์ Nextflow แล้ว
ขณะนี้ AWS HealthOmics รองรับโปรไฟล์ Nextflow ซึ่งช่วยให้ลูกค้าสามารถเปิดใช้งานการตั้งค่าการดำเนินงานที่กำหนดไว้ล่วงหน้าได้ในขณะรันงาน โปรไฟล์ Nextflow ช่วยให้ลูกค้าสามารถกำหนดชุดการตั้งค่าที่นำกลับมาใช้ซ้ำได้ และเลือกใช้งานชุดการตั้งค่าเหล่านั้นในขณะที่ดำเนินงาน ทำให้สามารถสลับระหว่างการตั้งค่าการดำเนินงานต่าง ๆ ได้อย่างง่ายดายโดยไม่ต้องแก้ไขซอร์สโค้ดของเวิร์กโฟลว์ AWS HealthOmics เป็นบริการที่มีสิทธิ์ตาม HIPAA ซึ่งช่วยให้ลูกค้าในอุตสาหกรรมการดูแลสุขภาพและวิทยาศาสตร์ชีวภาพเร่งการค้นพบทางวิทยาศาสตร์ในระดับขนาดใหญ่ด้วยเวิร์กโฟลว์ชีวสารสนเทศศาสตร์แบบที่มีการจัดการเต็มรูปแบบ
ด้วยโปรไฟล์ Nextflow จะทำให้คุณสามารถแยกการตั้งค่าเฉพาะแพลตฟอร์ม เช่น ขีดจำกัดทรัพยากรหรือทางเลือกในการดำเนินงาน ออกจากตรรกะหลักของเวิร์กโฟลว์ได้อย่างชัดเจน คุณสามารถสลับระหว่างการตั้งค่าสำหรับสภาพแวดล้อมการพัฒนาและสภาพแวดล้อมการใช้งานจริงได้ โดยไม่ต้องสร้างนิยามเวิร์กโฟลว์แยกกัน ซึ่งจะช่วยลดข้อผิดพลาดจากการแก้ไขด้วยตนเอง เพิ่มความสะดวกในการย้ายเวิร์กโฟลว์ไปใช้งานบนสภาพแวดล้อมต่าง ๆ และช่วยประหยัดเวลาเมื่อปรับขนาดการใช้งานจากสภาพแวดล้อมการพัฒนาไปสู่สภาพแวดล้อมการใช้งานจริง หากคุณใช้เวิร์กโฟลว์ของ nf-core ตอนนี้คุณสามารถเปิดใช้งานโปรไฟล์ในตัวและโปรไฟล์ระดับองค์กรที่มาพร้อมกับ Pipeline เหล่านั้นได้แล้ว
ขณะนี้ คุณสามารถระบุโปรไฟล์ Nextflow ได้ตั้งแต่หนึ่งรายการขึ้นไปในการรันเวิร์กโฟลว์ของคุณใน AWS HealthOmics Region ทุกแห่ง ได้แก่ สหรัฐอเมริกาฝั่งตะวันออก (เวอร์จิเนียฝั่งเหนือ), สหรัฐอเมริกาฝั่งตะวันตก (ออริกอน), ยุโรป (แฟรงก์เฟิร์ต, ไอร์แลนด์, ลอนดอน), อิสราเอล (เทลอาวีฟ) และเอเชียแปซิฟิก (สิงคโปร์, โซล) หากต้องการเรียนรู้เพิ่มเติม โปรดดูหัวข้อโปรไฟล์ Nextflow ในเอกสารประกอบการตั้งค่าเอ็นจิ้น Nextflow ของ HealthOmics