AWS HealthOmics теперь поддерживает профили Nextflow
AWS HealthOmics теперь поддерживает профили Nextflow, что позволяет клиентам активировать предопределенные настройки выполнения во время выполнения. Профили Nextflow позволяют клиентам определять повторно используемые настройки и выбирать их в момент выполнения, что упрощает переключение между настройками выполнения без изменения исходного кода рабочего процесса. AWS HealthOmics – это сервис, соответствующий требованиям закона США о мобильности и подотчетности медицинского страхования (HIPAA), который помогает клиентам из сфер здравоохранения и медико-биологических наук ускорять научные открытия в нужном масштабе за счет полностью управляемых рабочих процессов биоинформатики.
С помощью профилей Nextflow вы можете четко отделить специфичные для платформы настройки, такие как ограничения ресурсов или варианты выполнения, от основной логики рабочего процесса. Можно переключаться между настройками для среды разработки и производственной среды без создания отдельных определений рабочих процессов. Это уменьшает количество ошибок, связанных с ручным редактированием, ускоряет перенос рабочих процессов и экономит время при масштабировании от среды разработки до производственной среды. Если вы используете рабочие процессы nf-core, теперь вы можете активировать встроенные и институциональные профили, которые уже поставляются в этих конвейерах.
Теперь вы можете указать один или несколько профилей Nextflow в запусках рабочих процессов во всех регионах AWS HealthOmics: Восток США (Северная Вирджиния), Запад США (Орегон), Европа (Ирландия, Лондон, Франкфурт), Израиль (Тель-Авив) и Азиатско-Тихоокеанский регион (Сеул, Сингапур). Чтобы узнать больше, зайдите в раздел «Профили Nextflow» в документации по настройкам движка Nextflow HealthOmics.