Recursos do AWS HealthOmics

Aprenda a usar o AWS HealthOmics neste guia do desenvolvedor detalhado.

Leia este guia de referência para APIs e parâmetros do AWS HealthOmics.

Este guia traz orientações para instalar e usar o saber do Kiro do AWS HealthOmics e a Extensão da IDE dentro do ambiente Kiro IDE, com o objetivo de aprimorar a experiência durante o uso do HealthOmics.

Este guia apresenta o passo a passo para criar, implantar e executar fluxos de trabalho de genômica com o uso do AWS HealthOmics.

É possível solicitar à CLI do Kiro que elabore fluxos de trabalho, analise registros de execução e apresente recomendações para a otimização de desempenho.

Comece com fluxos de trabalho e armazenamento da HealthOmics

Repositório de código aberto no GitHub com código de exemplo que demonstra como armazenar, processar e consultar conjuntos de dados genômicos e biológicos através do AWS HealthOmics

Oferece realce de sintaxe, preenchimento de código e orientação para solução de problemas, além de verificação de compatibilidade com o mecanismo do HealthOmics, recomendações de otimização de performance, análise automatizada de execuções com diagnóstico de falhas e recursos de importação/exportação de fluxo de trabalho.

Dá orientação ao servidor MCP do HealthOmics e oferece ao agente do IDE do Kiro conhecimento especializado sobre a criação e otimização do fluxo de trabalho do HealthOmics.

Um servidor de protocolo de contexto para modelos (MCP) que oferece aos assistentes de IA acesso abrangente aos serviços do AWS HealthOmics para gerenciamento, execução e análise de fluxos de trabalho de genômica.

Use esta coleção de fluxos de trabalho do AWS HealthOmics para acelerar a descoberta de medicamentos

Crie fluxos de trabalho privados com base em exemplos de fluxo de trabalho de código aberto da HealthOmics

O Run Analyzer é uma ferramenta de otimização de desempenho de execução que recupera logs de manifestos de execução do CloudWatch e gera estatísticas para uma execução, incluindo a utilização da CPU e da memória para cada tarefa do fluxo de trabalho

Use o linter HealthOmics WDL para detectar erros comuns de fluxo de trabalho antes de executar fluxos de trabalho

Lint para erros comuns do Nextflow antes da execução de um script de fluxo de trabalho

Realize novamente execuções arquivadas a partir dos logs de manifesto de execução do CloudWatch

Baixe facilmente arquivos de uma referência ou conjunto de leitura do AWS HealthOmics

Aplicativo CDK que demonstra uma arquitetura orientada por eventos e automatiza a importação de dados para os armazenamentos de sequências do AWS HealthOmics quando objetos são criados no Amazon S3.

Gera um manifesto json para trabalhos de importação da loja de sequências do AWS HealthOmics

Identifica conjuntos de leitura duplicados em armazenamentos de sequências do AWS Healthomics

Esta orientação demonstra como construir um sistema de gerenciamento de dados científicos que integre dados de instrumentos de laboratório e sistemas de software, como cadernos eletrônicos de laboratório (ELNs) e sistemas de gerenciamento de informações de laboratório (LIMS), com HealthOmics.

Esta orientação ajuda você a conectar instrumentos de dados de ciências biológicas e arquivos de sistemas de laboratório à Nuvem AWS, seja pela Internet ou por uma conexão direta com baixa latência.

Esta orientação demonstra como importar dados de sequência ômica do Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) para o AWS HealthOmics Storage.

Esta orientação demonstra como configurar um framework completo para analisar dados multimodais de saúde e ciências biológicas (HCLS).

Esta orientação mostra como criar e executar fluxos de trabalho de bioinformática de nível de produção em grande escala e usar os serviços da AWS para automação, análise de fluxo de trabalho, armazenamento e observabilidade operacional e de custos.