AWS HealthOmics ora supporta i profili Nextflow
AWS HealthOmics ora supporta i profili Nextflow, consentendo ai clienti di attivare impostazioni di esecuzione predefinite al momento dell'esecuzione. I profili Nextflow consentono ai clienti di definire impostazioni riutilizzabili e di selezionarle al momento dell'esecuzione, semplificando il passaggio da un'impostazione di esecuzione all'altra senza modificare il codice sorgente del flusso di lavoro. AWS HealthOmics è un servizio idoneo all'HIPAA che aiuta i clienti del settore sanitario e delle scienze della vita ad accelerare le scoperte scientifiche su larga scala con flussi di lavoro di bioinformatica completamente gestiti.
Con i profili Nextflow, è possibile separare nettamente le impostazioni specifiche della piattaforma, come i limiti delle risorse o le opzioni di esecuzione, dalla logica principale del flusso di lavoro. È possibile passare dalle impostazioni di sviluppo a quelle di produzione senza dover creare definizioni di flusso di lavoro separate. Ciò riduce gli errori derivanti dalle modifiche manuali, accelera la portabilità del flusso di lavoro e consente di risparmiare tempo durante il passaggio dallo sviluppo alla produzione. Se si utilizzano i flussi di lavoro nf-core, ora è possibile attivare i profili integrati e istituzionali già inclusi in tali pipeline.
È possibile ora specificare uno o più profili Nextflow nelle esecuzioni del flusso di lavoro in tutte le regioni AWS HealthOmics: Stati Uniti orientali (Virginia settentrionale), Stati Uniti occidentali (Oregon), Europa (Francoforte, Irlanda, Londra), Israele (Tel Aviv) e Asia Pacifico (Singapore, Seul). Per saperne di più, consulta la sezione relativa ai profili Nextflow nella documentazione delle impostazioni del motore Nextflow di HealthOmics.