AWS HealthOmics prend désormais en charge les profils Nextflow
AWS HealthOmics prend désormais en charge les profils Nextflow, ce qui permet aux clients d’activer des paramètres d’exécution prédéfinis au moment de l’exécution. Les profils Nextflow permettent aux clients de définir des paramètres réutilisables et de les sélectionner au moment de l’exécution, ce qui permet de basculer facilement entre les paramètres d’exécution sans modifier le code source du flux de travail. AWS HealthOmics est un service éligible à la loi HIPAA qui aide les clients du secteur de la santé et des sciences de la vie à accélérer leurs avancées scientifiques à grande échelle grâce à des flux de travail bioinformatiques entièrement gérés.
Les profils Nextflow vous permettent de séparer clairement les paramètres spécifiques à la plateforme, tels que les limites de ressources ou les options d’exécution, de la logique de flux de travail de base. Vous pouvez basculer entre les paramètres de développement et de production sans créer de définitions de flux de travail distinctes. Cela permet de réduire les erreurs liées aux modifications manuelles, d’accélérer la portabilité des flux de travail et de gagner du temps lors de la transition entre le développement et la production. Si vous utilisez des flux de travail nf-core, vous pouvez désormais activer les profils intégrés et institutionnels avec lesquels ces pipelines sont déjà fournis.
Vous pouvez désormais spécifier un ou plusieurs profils Nextflow lors de l’exécution de votre flux de travail dans toutes les Régions AWS HealthOmics : USA Est (Virginie du Nord), USA Ouest (Oregon), Europe (Francfort, Irlande, Londres), Israël (Tel Aviv) et Asie-Pacifique (Singapour, Séoul). Pour en savoir plus, consultez la section sur les profils Nextflow dans la documentation des paramètres du moteur HealthOmics Nextflow.