AWS HealthOmics unterstützt jetzt Nextflow-Profile
AWS HealthOmics unterstützt jetzt Nextflow-Profile, sodass Kunden vordefinierte Ausführungseinstellungen zur Laufzeit aktivieren können. Nextflow-Profile ermöglichen es Kunden, wiederverwendbare Einstellungen festzulegen und sie zum Zeitpunkt der Ausführung auszuwählen. So ist es einfach, zwischen den Ausführungseinstellungen zu wechseln, ohne den Workflow-Quellcode zu ändern. AWS HealthOmics ist ein HIPAA-kompatibler Service, der Kunden aus dem Gesundheitswesen und den Biowissenschaften hilft, wissenschaftliche Durchbrüche skaliert mit vollständig verwalteten Bioinformatik-Workflows zu beschleunigen.
Mit Nextflow-Profilen können Sie plattformspezifische Einstellungen, wie Ressourcenbegrenzungen oder Ausführungsoptionen, von der Kernworkflow-Logik trennen. Sie können zwischen Entwicklungs- und Produktionseinstellungen wechseln, ohne separate Workflow-Definitionen zu erstellen. Dies reduziert Fehler aufgrund manueller Änderungen, beschleunigt die Workflow-Portabilität und spart Zeit bei der Skalierung von der Entwicklung bis zur Produktion. Wenn Sie nf-core-Workflows verwenden, können Sie jetzt die integrierten und institutionellen Profile aktivieren, mit denen diese Pipelines bereits ausgeliefert werden.
Sie können jetzt ein oder mehrere Nextflow-Profile in Ihren Workflow-Ausführungen in allen AWS HealthOmics-Regionen angeben: USA Ost (Nord-Virginia), USA West (Oregon), Europa (Frankfurt, Irland, London), Israel (Tel Aviv) und Asien-Pazifik (Singapur, Seoul). Weitere Informationen finden Sie im Abschnitt „Nextflow-Profile“ in der Dokumentation zu den Einstellungen für die Nextflow-Engine in Healthomics.